在前次大战发生的2年之后，失踪的莫丁将军带着新的部队卷土重来。在前次大战中拯救世界的“游隼”部队成员马可·罗斯少校(前作为中尉)和塔尔玛· 洛文上尉(前作为少尉)为此再度出击。而这次，他们拥有了两名新伙伴：来自“游隼”的支援部队“麻雀”的女性士官笠本英里中士和菲欧·杰尔米上士。而在战斗过程中，暗藏在莫丁背后的一个更大的敌人也渐渐浮出水面，感兴趣的小伙伴赶快点击下载吧！
运行说明
pc：下载街机模拟器，安装完成后，找到rom，双击（或右键单击后选择“打开”），找到根目录下的setup.exe文件，双击进行安装，即可运行。
手机版：手机版由于是街机游戏同样需要使用街机模拟器，玩家可以自行在网上下载，或直接安装街机123即可。
游戏特色
新敌人
阿拉伯兵：第一关出现，投掷弯刀攻击主角。
阿拉伯大刀兵：第一、二关出现，冲向主角用大砍刀攻击，出刀速度极快。
木乃伊：第二关出现，有普通的喷紫色毒烟木乃伊和吐出毒物滚雷的白色木乃伊，使用霰弹枪S或火焰枪F能够对其造成强力伤害。
生化自爆人：第五关出现，用手脚在墙壁和地面爬行的生化人，出现后体色渐渐变红并自爆。
火星人：第六关出现，章鱼般的外形相信是来自于赫伯特·乔治·威尔斯的科幻小说《世界大战》的发想，灰色的为一般型，发射黄色的泡泡状子弹；黑色的为精锐部队，有的会发射出速度更快的蓝色子弹。后来在SVCChaos:SNKVS.CAPCOM和NEOGEOBattlecoliseum中此角色作为隐藏人物出场。
更丰富的角色动作
在2代中，让主角站立不动一段时间时，主角会做出一些比1代更加丰富的动作，如男主角会站在原地打瞌睡，笠本英里会嚼泡泡糖等，若是在寒冷或炎热的场景下，主角还会做出发抖或擦汗的动作。
而在某些地方，近身攻击也不再仅仅限于使用匕首。两位女主角的近身武器是手斧和丁字拐。在一些特定场合，男主角的站立近身攻击变为用脚踢，下蹲时则是从背包中弹出拳击手套；笠本英里使用空手道攻击，而菲欧是用双手推敌人。
新型俘虏
2代中的人质除了传统的提供给玩家道具的俘虏外，还出现了可以协助玩家作战的人质“一文字百太郎”。其外形和普通俘虏一样，但会使用“波动拳”协助玩家作战。如能保留至关底其给予的奖励分数将比普通俘虏略高。
另外在第二、五关以及第三关关底可以看到一个背着背包的女孩“相川留美”，打破她的背包会漏出一些道具，若在她跑掉之前撞倒她，她也会再提供一个道具。在关底计分时也将作为一个特殊俘虏进行额外加分。但需要注意的是若迟迟不将其撞倒，她会留下一个道具后跑开，这种情况下在关底是得不到额外分数的。
改良的操作
SNK接手后对游戏的操作进行了一些改良，2代的操作手感和1代比大大改善，这种改善尤其体现在跳跃和使用重机枪H进行90度扫射上，后来的续作均延续了这一代的良好手感。
游戏流程编辑和前作一样，合金弹头2也有6关，在最后莫丁被外星人所擒后，原本的敌人将会协助我方作战。
