狙击精英3这款游戏故事发生在第二次世界之后，地点是在德国的柏林。德国纳粹党人的势力已经开始逐步走向衰败。斯大林为了尽快掌握原子弹的制造技术，专门派遣苏联特务机关去窃取德国研究原子弹的机密情报。美国为了阻止它的这一行动，特派出伪装成德军的狙击手，潜入德国去阻止苏联先行一步获得原子弹的机密资料。这样一来，各国为了自己的利益秘密行动便展开了。