机动战士高达Seed格斗在系统上没多大变化，基本上算是对前作的补充和完善。颇具突破性的是本作的战斗画面不仅采用了1：1真实比例机体，还起用了时下最流行的动画渲染技术，原作中大魄力的镜头得以逼真还原，代入感倍增。每作战斗前的剧情游戏详情中都会加入动画中的熟悉场面和部分动画。本作中Seed爆发后，角色的防御、回避、命中、威力等各方面能力都会增加。